$ ./configure --with-ispack=/usr/local/lib/libisp.a \
              --with-netcdf=/usr/local/lib/libnetcdf.a \
              --with-gt4f90io=/usr/local/lib/gt4f90io/lib/libgt4f90io.a \
              --with-spml=/usr/local/lib/spml/lib/libspml.a \

Config.mk ファイルが生成されると同時に, config.cache ファイルが作成され, オプションの情報が保持されます. 自動的に config.cache が読み込まれるため, 再度 ./configure する際は前回のオプションが引き継がれます. もしも前回以前のオプション設定を破棄したい場合には以下のコマンドを用いてください.

$ make distclean

Debian GNU/Linux で Fujitsu Fortran を利用している場合には, Config.cache.debian-ffc* を config.cache に移動して ./configure コマンドを実行するだけで自動的にライブラリの位置が設定されます.

$ cp Config.cache.debian-ffc5 config.cache
$ ./configure

なお, インストール先やコンパイルのオプションを変更したい場合は, 以下のように --help オプションをつけることで, 指定可能なオプションリストが表示されます.

$ ./configure --help

主なオプションに関しての説明です.

--prefix=ARG: ARG にライブラリやモジュール, 実行ファイルのインストール先のディレクトリのプレフィックスを指定します. デフォルトは /usr/local/dcpam3 です.
--libdir=ARG: ARG にライブラリのインストール先のディレクトリを指定します. デフォルトは /usr/local/dcpam3/lib です.
--includedir=ARG: ARG にモジュール情報ファイルのインストール先のディレクトリを指定します. デフォルトは /usr/local/dcpam3/include です.
--bindir=ARG: ARG に実行ファイルのインストール先のディレクトリを指定します. デフォルトは /usr/local/dcpam3/bin です.
--with-docdir=ARG: ARG にドキュメントファイルのインストール先を指定します. デフォルトは /usr/local/dcpam3/doc です.
--with-fc=ARG: Fortran コンパイラを指定します. 環境変数 $FC よりも優先されます. config.cache に設定されたものを上書きする際に利用してください. (一度 config.cache に Fortran コンパイラが指定されると, 環境変数 $FC は無視されます).
--with-fflags=ARG: Fortran のデバッグや最適化のオプションを指定します. 環境変数 $FFLAGS が指定される場合, このオプションで与えられるものも含め, 全てコンパイル時のオプションとして指定されます. (重複に注意してください).
--with-dcpam_lib_name=ARG: ARG に dcpam3 のライブラリ名を指定します. ライブラリ名は lib<ARG>.a となります. デフォルトは dcpam3 であり, その際のライブラリ名は libdcpam3.a となります.
--with-dcpam_suffix=ARG: ARG にはインストールディレクトリ, ライブラリ名, 実行ファイルの末尾につける接尾語を指定します. 例えば, 他が全てデフォルトの設定で ffc5 と指定すると, インストール先のディレクトリのプレフィックスが /usr/local/dcpam3-ffc5 , ライブラリ名が libdcpam3-ffc5.a 等のようになります.
--with-lang_conform_check=ARG: ARG に言語規格を指定することで, コンパイル時に言語規格のチェックを行うよう, オプションを追加します. 現在 "95" のみ指定可能です. コンパイラによっては指定できません.
--enable-debug: このオプションを指定することで, コンパイル時や実行時にデバッグメッセージを出力するオプションを追加します. コンパイラによっては指定できません.